El dilema de la identificación de Aeromonas y el diagnóstico de subespecies
Chile: Científicos chilenos proponen utilizar el análisis filogenético multilocus y genes housekeeping para la identificación se subespecies de Aeromonas salmonicida.
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Previo a la era de la genómica, la mayoría de las especies de Aeromonas se clasificaban de acuerdo a su temperatura de crecimiento, movilidad y producción de pigmento. En la actualidad se conoce que la identificación a nivel de especie usando caracterización fenotípica es difícil debido al comportamiento variable de las cepas, desvirtuando la prevalencia real de las Aeromonas.
“Todo esto ha generado una amplia confusión y ambigüedad tanto alrededor de esta especie como del término furunculosis atípica”, plantean los autores de un artículo publicado en la última edición de revista Salmonexpert.
De acuerdo a los autores, la incapacidad para caracterizar diferentes aislados como A. salmonicida subsp. salmonicida ha conducido a numerosos autores a describir la presencia de cepas de A. salmonicida atípicas, nombre que reciben aquellas que no se ajustan a las características de la subespecie salmonicida y que pueden o no identificarse como alguna de las otras subespecies.
Para estos fines, los investigadores señalan que el gen 16S ARNr no es recomendable sino solamente para confirmar la pertenencia al género, debido a que este gen tiene un rango de similitud entre especies de 96,7-100% y las posiciones informativas de los nucleótidos se encuentran principalmente en la región V3.
“Por esta razón, en los últimos años numerosos autores han demostrado que el Multilocus Phylogenetic Analysis (MLPA), es recomendable para la identificación a nivel de especie y subespecie los aislados de Aeromonas” , explican los científicos.
Así, sostienen que genes housekeeping serían una alternativa válida, donde los genes gyrB y rpoD sería los principales. No obstante también han sido empleados en la identificación taxonómica los genes rpoB, recA, dnaJ, cpn60, mdh, gyrA, dnaX, atpD, groL, gltA, metG, ppsA, dnaK, radA, tsF y zipA.
Para leer el artículo completo de los autores R. Avendaño-Herrera, H. Araya-León y R. Irgang, revise la última edición de revista Salmonexpert haciendo click aquí (páginas 40-44).
